Der Verwaltungsrat unter dem Vorsitz von Valérie Pécresse, die auch Präsidentin der Region Île-de-France ist, setzt sich aus lokalen Mandatsträgern (Region, Departements und Stadt Paris) zusammen. Er stimmt über die Maßnahmen ab, die das ordnungsgemäße Funktionieren des Netzes der Île-de-France Mobilités und seine laufende Modernisierung gewährleisten sollen.
Die Île-de-France Mobilités besteht aus mehr als 400 Mitarbeitern und wird von Laurent Probst, dem Geschäftsführer, geleitet.