Presieduto da Valérie Pécresse, anche presidente della Regione Île-de-France, il consiglio di amministrazione è composto da rappresentanti eletti a livello locale (regione, dipartimenti e città di Parigi). Vota le misure che garantiscono il buon funzionamento della rete Île-de-France Mobilités e la sua continua modernizzazione.
Île-de-France Mobilités è composta da oltre 400 persone guidate da Laurent Probst, il suo direttore generale.